主要從事地理信息系統建模理論與應用方法研究，先后承擔并完成了十余項基礎研究類項目，其中包括2項國家自然科學基金重點項目和3項面上項目以及國家杰出青年科學基金項目、國家教委霍英東基金項目、國家教委跨世紀優秀人才基金項目；主持研制了國家陸地邊界數據庫系統等十余項工程類項目。共在國際學術刊物和國內核心刊物上發表了近100篇學術論文，發表了1本學術專著，合作發表了3本學術和科普圖書。研究成果先后獲得國家測繪科技進步一、二等獎，學術專著“Voronoi動態空間數據模型”2003年獲全國優秀科技圖書三等獎。
1987年被評為“國家級有突出貢獻的中青年專家”；1993年被國務院學位辦批準為博士生導師；1994年入選國家教委“跨世紀優秀人才培養計劃”；1999年入選人事部“百千萬人才工程”計劃；2000年獲得國家杰出青年科學基金;2003年當選國際歐亞科學院院士；2003年9月獲得中組部、人事部等頒發的“留學回國人員成就獎”。
1975年9月到安徽省測繪局第二測繪大隊工作
1983年9月起在武漢測繪科技大學任教，歷任遙感教研室助教、副主任(1984-1989)、副教授(1987-)、測繪遙感信息工程國家重點實驗室常務副主任(1990-1995)、教授(1992-)、博士生導師(1993-)。1995年12月調國家基礎地理信息中心工作，歷任副主任(1995-1998)、代主任(1998-2000)、主任(2000-)。
曾任國家基礎地理信息中心總工程師。
2017年11月13日，國家測繪地理信息局黨組決定：免去陳軍同志的國家基礎地理信息中心總工程師職務。
1976年12月入武漢測繪科技大學攝影測量與遙感專業學習
1979年9月起攻讀該專業碩士學位(導師為王之卓院士、楊凱教授)
1981-1982年在法國地理院學習遙感技術
環球新時空
斗室智庫